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Method for analyzing DNA methylation

外国特許コード F130007493
掲載日 2013年7月10日
出願国 アメリカ合衆国
出願番号 201113641923
公報番号 20130045478
公報番号 8980560
出願日 平成23年4月21日(2011.4.21)
公報発行日 平成25年2月21日(2013.2.21)
公報発行日 平成27年3月17日(2015.3.17)
国際出願番号 JP2011060339
国際公開番号 WO2011132798
国際出願日 平成23年4月21日(2011.4.21)
国際公開日 平成23年10月27日(2011.10.27)
優先権データ
  • 特願2010-098163 (2010.4.21) JP
  • 2011JP060339 (2011.4.21) WO
発明の名称 (英語) Method for analyzing DNA methylation
発明の概要(英語) This invention provides a method for efficiently detecting DNA methylation.
The method for detecting DNA methylation comprises subjecting DNA to bisulfite treatment, subjecting DNA after bisulfite treatment to a first PCR, subjecting the resultant to nested PCR, and subjecting amplified DNA to denaturing gradient gel electrophoresis.
特許請求の範囲(英語) [claim1]
1. A method for detecting DNA methylation comprising steps of: subjecting DNA to bisulfite treatment;
subjecting the DNA after bisulfite treatment to a first PCR using the first set of primers corresponding to outer regions of the target region, the first set of primers selected from the group consisting of SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 30, and SEQ ID NO: 31;
subjecting the amplified DNA after the first PCR to a second PCR using the second set of primers corresponding to the target region, the second set of primers selected from the group consisting of SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 32, and SEQ ID NO: 33; and
subjecting the amplified DNA after the second PCR to denaturing gradient gel electrophoresis,
wherein the annealing positions of the second set of primers are located inside the annealing positions of the first set of primers relative to the target region.
[claim2]
2. The method according to claim 1, wherein one primer from the second set of primers has a GC-clamp sequence at its 5' side.
[claim3]
3. The method according to claim 1, wherein the density gradient of the denaturing gradient gel is limited to a density gradient of a denaturing agent in the gel comprising acrylamide and the denaturing agent.
  • 発明者/出願人(英語)
  • YOKOYAMA SEIYA
  • YONEZAWA SUGURU
  • KAGOSHIMA UNIVERSITY
国際特許分類(IPC)
米国特許分類/主・副
  • 435/6.11
  • 435/6.12
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