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TEST METHOD FOR MALT LYMPHOMA AND KIT THEREFOR

Foreign code F080002051
File No. F080002051
Posted date Mar 27, 2009
Country WIPO
International application number 2007JP062139
International publication number WO 2007/145325
Date of international filing Jun 15, 2007
Date of international publication Dec 21, 2007
Priority data
  • P2006-167817 (Jun 16, 2006) JP
Title TEST METHOD FOR MALT LYMPHOMA AND KIT THEREFOR
Abstract It is intended to provide a test method for MALT lymphoma for providing genetic diagnosis data which can be used for the diagnosis of MALT lymphoma, identification of disease type, progression of pathological conditions, and prediction of the onset thereof, and a kit for implementing the method. Two or more tumor suppressor genes or cancer-related genes in a sample are selected, particularly two or more genes are selected from the gene group consisting of 11 genes, and the expression level of the selected genes or the state of regulation of gene expression thereof is examined. To be more specific, the gene product is determined, and the expression profile of the gene group is constructed based on the determination results or an early detection/diagnosis with high sensitivity and accuracy is performed based on the examination of regulation of expression by detection of methylation frequency. Data for diagnosing MALT lymphoma or for evaluating the possibility to develop into a disease type requiring therapy, and data for making early detection of development into a disease type with poor prognosis.
Scope of claims (In Japanese)
【請求項1】検体中の2種以上の癌抑制遺伝子または癌関連遺伝子を選択して、その選択した遺伝子のプロモーター領域におけるCpG島のメチル化頻度を測定することにより、MALTリンパ腫の検出および/または診断のためのデータ、MALTリンパ腫の進展を評価するためのデータ、あるいはMALTリンパ腫の発症を予見するためのデータを提供することを特徴とするMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項2】検体中のKIP2遺伝子、p15遺伝子、p16遺伝子、p73遺伝子、hMLH遺伝子、DAPK遺伝子、MGMT遺伝子、MINT1遺伝子、MINT2遺伝子、MINT31遺伝子およびHCAD遺伝子よりなる遺伝子群から、少なくとも2種以上の遺伝子を選択し、その選択した遺伝子のプロモーター領域におけるCpG島のメチル化頻度を測定することにより、MALTリンパ腫の検出および/または診断のためのデータ、MALTリンパ腫の進展を評価するためのデータ、あるいはMALTリンパ腫の発症を予見するためのデータを提供することを特徴とするMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項3】前記の選択された遺伝子の一つがKIP2遺伝子である、請求項1または2に記載のMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項4】前記メチル化頻度の検出にメチル化感受性制限酵素を用いることを特徴とする、請求項1または2に記載のMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項5】前記メチル化頻度の検出を、検体を溶解して得た細胞溶解液を重亜硫酸塩で処理した後に行なうことを特徴とする、請求項1~4のいずれかに記載のMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項6】前記メチル化頻度の検出を、検体を溶解して得た細胞溶解液を直接に重亜硫酸塩で処理し、検体から遺伝子DNAを抽出せずに行なうことを特徴とする、請求項1~5のいずれかに記載のMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項7】Helicobacter pyroli菌キャリアである被験者について実施される、請求項1~6のいずれかに記載のMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項8】検体中のKIP2遺伝子、p15遺伝子、p16遺伝子、p73遺伝子、hMLH遺伝子、DAPK遺伝子、MGMT遺伝子、MINT1遺伝子、MINT2遺伝子、MINT31遺伝子およびHCAD遺伝子よりなる遺伝子群から2種以上の遺伝子を選択し、その選択した遺伝子の発現レベルを調べることにより、MALTリンパ腫の検出および/または診断のためのデータ、MALTリンパ腫の進展を評価するためのデータ、あるいはMALTリンパ腫の発症を予見するためのデータを提供することを特徴とするMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項9】選択した遺伝子の発現レベルをmRNAレベルで検出することを特徴とする、請求項8に記載のMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項10】選択した遺伝子の発現レベルを、その遺伝子がコードするタンパク質レベルで検出することを特徴とする、請求項8または9に記載のMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項11】前記検体が、扁桃、骨髄、リンパ節、消化器、呼吸器、脾臓、肝臓、感覚器、中枢神経系、運動器、皮膚、泌尿生殖器、乳腺を含む外分泌器、甲状腺を含む内分泌器および末梢血よりなる群から選択された器官、組織から採取された細胞含有検体である、請求項1~10のいずれかに記載のMALTリンパ腫の検査方法。

【請求項12】請求項1~7のいずれかに記載の検査方法を実施するためのキットであり、検体を溶解するための溶解液、重亜硫酸塩含有試薬、メチル化検出増幅試薬を少なくとも含み、2種以上の選択された癌抑制遺伝子または癌関連遺伝子のプロモーター領域におけるCpG島のメチル化プロファイルを作製することを特徴とするキット。

【請求項13】前記検体が、扁桃、骨髄、リンパ節、消化器、呼吸器、脾臓、肝臓、感覚器、中枢神経系、運動器、皮膚、泌尿生殖器、乳腺を含む外分泌器、甲状腺を含む内分泌器および末梢血よりなる群から選択された器官、組織から採取された細胞含有検体であり、これを前記溶解液によって溶解して得られた細胞溶解液を、それよりDNAを抽出することなく直接に重亜硫酸塩の処置をすることを特徴とする請求項12に記載のキット。
  • Applicant
  • ※All designated countries except for US in the data before July 2012
  • National University Corporation Okayama University
  • Inventor
  • Oka, Takashi
  • Kondo, Takami
  • Yoshino, Tadashi
  • Ouchida, Mamoru
IPC(International Patent Classification)
Specified countries AE AG AL AM AT AU AZ BA BB BE BF BG BH BJ BR BW BY BZ CA CF CG CH CI CM CN CO CR CU CY CZ DE DK DM DO DZ EC EE EG ES FI FR GA GB GD GE GH GM GN GQ GR GT GW HN HR HU ID IE IL IN IS IT JP KE KG KM KN KP KR KZ LA LC LK LR LS LT LU LV LY MA MC MD MG MK ML MN MR MT MW MX MY MZ NA NE NG NI NL NO NZ OM PG PH PL PT RO RS RU SC SD SE SG SI SK SL SM SN SV SY SZ TD TG TJ TM TN TR TT TZ UA UG US UZ VC VN ZA ZM ZW

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