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Method and a system for predicting protein functional site, a method for improving protein function, and a function-modified protein

外国特許コード F110003599
整理番号 E04401US3
掲載日 2011年6月30日
出願国 アメリカ合衆国
出願番号 80644807
公報番号 20080262201
公報番号 7820423
出願日 平成19年5月31日(2007.5.31)
公報発行日 平成20年10月23日(2008.10.23)
公報発行日 平成22年10月26日(2010.10.26)
国際出願番号 JP1998000430
国際公開番号 WO1998033900
国際出願日 平成10年2月2日(1998.2.2)
国際公開日 平成10年8月6日(1998.8.6)
優先権データ
  • 特願1997-019248 (1997.1.31) JP
  • 特願1997-019249 (1997.1.31) JP
  • 特願1997-332100 (1997.12.2) JP
  • 特願1998-018699 (1998.1.30) JP
  • 1998WO-JP00430 (1998.2.2) WO
  • 1999US-09355486 (1999.9.20) US
  • 2000US-09697138 (2000.10.27) US
  • 2003US-10345205 (2003.1.16) US
発明の名称 (英語) Method and a system for predicting protein functional site, a method for improving protein function, and a function-modified protein
発明の概要(英語) (US7820423)
The present application provides a method for predicting the functional site of a protein using data of the entire proteins of an organism of which genome data or cDNA data is known.
More specifically, the present application provides a method for predicting a protein functional site, comprising the steps of calculating the frequency of occurrence of an oligopeptide in the entire proteins, calculating the value of each amino-acid residue contributing to the frequency of occurrence as the representative value of the function, and predicting the protein functional site by using the representative value of function as an indicator.
The present also provides a system for predicting a functional site for automatically performing said methods.
Additionally, the present application provides a method for preparing a function-modified protein comprising subjecting the amino-acid residues composing the functional site identified by the method described above to artificial mutation, and a novel thermophilic DNA polymerase prepared by the method.
特許請求の範囲(英語) [claim1]
1. A thermophilic DNA polymerase consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 6.
  • 発明者/出願人(英語)
  • DOI HIROFUMI
  • HIRAKI HIDEAKI
  • KANAI AKIO
  • JAPAN SCIENCE AND TECHNOLOGY AGENCY
国際特許分類(IPC)
参考情報 (研究プロジェクト等) ERATO DOI Bioasymmetry AREA
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