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METHOD FOR DETECTING DRUG RESISTANCE MUTATION IN CYTOMEGALOVIRUS, AND METHOD FOR IDENTIFYING DRUG RESISTANCE MUTATION GENE commons

Foreign code F150008078
Posted date Jan 23, 2015
Country WIPO
International application number 2013JP069598
International publication number WO 2014014077
Date of international filing Jul 19, 2013
Date of international publication Jan 23, 2014
Priority data
  • P2012-161040 (Jul 20, 2012) JP
Title METHOD FOR DETECTING DRUG RESISTANCE MUTATION IN CYTOMEGALOVIRUS, AND METHOD FOR IDENTIFYING DRUG RESISTANCE MUTATION GENE commons
Abstract [Problem] To provide a novel primer set to be used for quickly detecting a mutation in UL97 gene and/or UL54 gene to thereby detect drug-resistant cytomegalovirus. [Solution] A novel primer set that enables the analysis of the second half region of UL97 gene, wherein a mutation relating to drug resistance is reported, and a region corresponding to 92% or greater of UL54 gene region.
Scope of claims (In Japanese)[請求項1]
サイトメガロウイルスの薬剤耐性変異の検出方法であって、
サイトメガロウイルスのUL97遺伝子の変異を検出するための下記プラーマーセット(A)と、サイトメガロウイルスのUL54遺伝子の変異を検出するためのプライマーセット(B)またはプライマーセット(C)のうち、いずれか1つとを組み合わせで用いる検出方法。
<プライマーセット(A)>
プライマー1:5’-tgcccaaagaggacgatttt-3’ (配列番号1)
プライマー2:5’-gtagtccaaactcgagacgc-3’ (配列番号2)
<プライマーセット(B)>
プライマー3:5’-acggtcagacggggttgatcaagca-3’(配列番号3)
プライマー4:5’-agcacgttggttacagccttgagaacct-3’(配列番号4)
<プラーマーセット(C)>
プライマー5:5’-tcattgccagcgtgggcgaactagtg-3’(配列番号5)
プライマー4:5’-agcacgttggttacagccttgagaacct-3’(配列番号4)
[請求項2]
サイトメガロウイルスの薬剤耐性変異が、サイトメガロウイルスのUL97遺伝子産物の400番目のアミノ酸以降の変異およびサイトメガロウイルスのUL54遺伝子産物のアミノ変異である請求項1記載の検出方法。
[請求項3]
検出方法がPCRを利用する方法であって、サイトメガロウイルスのUL54の変異を検出するPCRが、ステップダウンPCRである請求項1または2記載の検出方法。
[請求項4]
サイトメガロウイルスの薬剤耐性変異の同定方法であって、以下の工程を含む同定方法。
(1)工程1:サイトメガロウイルスのUL97遺伝子の後半領域の約1.3kbpを以下のプライマーセット(A)でPCR法により増幅して塩基配列を解析し、アミノ酸変異の有無を調べる工程、
<プライマーセット(A)>
プライマー1:5’-tgcccaaagaggacgatttt-3’ (配列番号1)
プライマー2:5’-gtagtccaaactcgagacgc-3’ (配列番号2)
(2)工程2:サイトメガロウイルスのUL54遺伝子のほぼ全域の約3.4kbpを以下のプライマーセット(B)またはプライマーセット(C)でPCR法により増幅して塩基配列を解析し、アミノ酸変異の有無を調べる工程とを有する。
<プライマーセット(B)>
プライマー3:5’-acggtcagacggggttgatcaagca-3’(配列番号3)
プライマー4:5’-agcacgttggttacagccttgagaacct-3’(配列番号4)
<プラーマーセット(C)>
プライマー5:5’-tcattgccagcgtgggcgaactagtg-3’(配列番号5)
プライマー4:5’-agcacgttggttacagccttgagaacct-3’(配列番号4)
[請求項5]
前記工程2におけるPCR法が、ステップダウンPCRである請求項4記載の同定方法。
[請求項6]
サイトメガロウイルスの薬剤耐性変異の検出または同定に用いる以下のプライマーセット(A)と、プライマーセット(B)又は(C)のうち、いずれか1つの組合せからなるプラーマーセット。
<プライマーセット(A)>
プライマー1:5’-tgcccaaagaggacgatttt-3’ (配列番号1)
プライマー2:5’-gtagtccaaactcgagacgc-3’ (配列番号2)
<プライマーセット(B)>
プライマー3:5’-acggtcagacggggttgatcaagca-3’(配列番号3)
プライマー4:5’-agcacgttggttacagccttgagaacct-3’(配列番号4)
<プラーマーセット(C)>
プライマー5:5’-tcattgccagcgtgggcgaactagtg-3’(配列番号5)
プライマー4:5’-agcacgttggttacagccttgagaacct-3’(配列番号4)
[請求項7]
サイトメガロウイルスのUL97遺伝子変異の検出または同定に用いる以下のプラーマーセット(A)。
プライマー1:5’-tgcccaaagaggacgatttt-3’ (配列番号1)
プライマー2:5’-gtagtccaaactcgagacgc-3’ (配列番号2)
[請求項8]
サイトメガロウイルスのUL54遺伝子変異の検出または同定に用いる以下のプラーマーセット(B)。
プライマー3:5’-acggtcagacggggttgatcaagca-3’(配列番号3)
プライマー4:5’-agcacgttggttacagccttgagaacct-3’(配列番号4)
[請求項9]
サイトメガロウイルスのUL54遺伝子変異の検出または同定に用いる以下のプラーマーセット(C)。
プライマー5:5’-tcattgccagcgtgggcgaactagtg-3’(配列番号5)
プライマー4:5’-agcacgttggttacagccttgagaacct-3’(配列番号4)
  • Applicant
  • ※All designated countries except for US in the data before July 2012
  • UNIVERSITY OF TOYAMA
  • Inventor
  • DAIKOKU TOHRU
  • SHIRAKI KIMIYASU
IPC(International Patent Classification)
Specified countries National States: AE AG AL AM AO AT AU AZ BA BB BG BH BN BR BW BY BZ CA CH CL CN CO CR CU CZ DE DK DM DO DZ EC EE EG ES FI GB GD GE GH GM GT HN HR HU ID IL IN IS JP KE KG KN KP KR KZ LA LC LK LR LS LT LU LY MA MD ME MG MK MN MW MX MY MZ NA NG NI NO NZ OM PA PE PG PH PL PT QA RO RS RU RW SC SD SE SG SK SL SM ST SV SY TH TJ TM TN TR TT TZ UA UG US UZ VC VN ZA ZM ZW
ARIPO: BW GH GM KE LR LS MW MZ NA RW SD SL SZ TZ UG ZM ZW
EAPO: AM AZ BY KG KZ RU TJ TM
EPO: AL AT BE BG CH CY CZ DE DK EE ES FI FR GB GR HR HU IE IS IT LT LU LV MC MK MT NL NO PL PT RO RS SE SI SK SM TR
OAPI: BF BJ CF CG CI CM GA GN GQ GW KM ML MR NE SN TD TG
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