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LIGHT-RESPONSIVE ARTIFICIAL NUCLEOTIDE HAVING PHOTO-CROSSLINKING ABILITY

Patent code P170013759
File No. J1019-01JP-2
Posted date Mar 15, 2017
Application number P2012-018539
Publication number P2012-121899A
Patent number P5427902
Date of filing Jan 31, 2012
Date of publication of application Jun 28, 2012
Date of registration Dec 6, 2013
Priority data
  • P2007-299914 (Nov 19, 2007) JP
Inventor
  • (In Japanese)藤本 健造
  • (In Japanese)吉村 嘉永
  • (In Japanese)鳥羽 慎也
  • (In Japanese)新田 ゆかり
Applicant
  • (In Japanese)国立研究開発法人科学技術振興機構
Title LIGHT-RESPONSIVE ARTIFICIAL NUCLEOTIDE HAVING PHOTO-CROSSLINKING ABILITY
Abstract PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a photoreactive crosslinking agent that is capable of crosslinking a sequence which cannot be photo-crosslinked by psoralen, and is capable of photo-crosslinking using a light having a longer wavelength, as compared with psoralen.
SOLUTION: The photoreactive crosslinking agent is a compound comprising a carbazolyl group substituted with a vinyl group which may be substituted, at a third position, coupled to a saccharide group, polysaccharide group or the like, at a first position of the carbazolyl group. The saccharide group is, for example, represented by the formula.
Outline of related art and contending technology (In Japanese)

分子生物学の分野の基本的な技術に、核酸の連結がある。核酸の連結は、例えば、ハイブリダイゼーションと組みあわせて、遺伝子の導入や、塩基配列の検出のために使用される。そのために、核酸の連結は、分子生物学の基礎研究だけではなく、例えば、医療分野における診断や治療、あるいは治療薬や診断薬等の開発や製造、工業及び農業分野における酵素や微生物等の開発や製造に使用される極めて重要な技術である。

核酸の連結は、例えば、DNAリガーゼ等を使用して従来から行われている。しかし、このような生体内の酵素反応を取り出した反応は、特別な条件設定を行わなければならず、さらに、使用される酵素類が比較的高価で、安定性に乏しい等の欠点を有する。このような欠点を克服するために、酵素類を使用しない核酸の連結の技術が研究されてきた。

酵素類を使用しない核酸の連結の技術として、核酸と反応性のある有機化合物を使用する方法がある。近年、光反応を利用した核酸連結技術が、反応の時間的空間的な制御が自由であること、一般的な有機化学反応よりも緩和な条件で反応可能であること等の利点から、注目されるようになってきた。
このような光連結技術として、5-シアノビニルデオキシウリジンを使用した光連結技術(特許文献1:特許第3753938号公報、特許文献2:特許第3753942号公報)が知られている。

核酸の連結と近似した重要な技術に、核酸の架橋がある。例えば、DNAやRNAの架橋反応は、細胞内の遺伝情報の流れを遮断して、遺伝子発現の阻害に使用される。DNAの架橋剤としては、光反応によって架橋を生じる光架橋剤(光クロスリンク剤)としてソラレンという化合物が古くから用いられている。光架橋剤であるソラレンを医薬品として服用して光照射を行う治療方法は、皮膚疾患である乾癬の標準的な治療方法の一つとして普及している。

しかし、ソラレンの光架橋反応は、核酸二本鎖中の5’-TA-3’配列に対して優先的に起こるために、使用できる対象が限定されているという問題がある。また、ソラレンの光連結波長は350nmで、光開裂波長は250nmであることから、ソラレンを光架橋剤として使用する場合には、短波長の光源を使用する必要があり、光照射によりDNAや細胞に損傷を与えやすいという問題がある。
【特許文献1】
特許第3753938号公報
【特許文献2】
特許第3753942号公報

Field of industrial application (In Japanese)

本発明は、核酸類と架橋可能な光反応性の核酸塩基類似構造を有する光反応性架橋剤、及び該構造を塩基部分として備えた光クロスリンク能を有する光応答性人工ヌクレオチドに関する。

Scope of claims (In Japanese)
【請求項1】
 
次の式I:
【化1】
 
(省略)
(ただし、式I中、Raは、シアノ基、アミド基、カルボキシル基、C2~C7のアルコキシカルボニル基、又は水素であり、
R1及びR2は、それぞれ独立に、シアノ基、アミド基、カルボキシル基、C2~C7のアルコキシカルボニル基、又は水素である。)
で表される基と、次の式II:
式II Rb-
(ただし、Rbは、次の式:
【化2】
 
(省略)
で表される基である。)
で表される基とが、式Iのカルバゾール環の9位のNの一価の遊離原子価と式IIのデオキシリボース環の1位のCの一価の遊離原子価とで、結合してなる化合物。
IPC(International Patent Classification)
F-term
State of application right Registered
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