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(In Japanese)DNA折り畳み転移において塩濃度依存的に形成される分子鎖内相分離構造

Research report code R000000641
Posted date Sep 30, 2002
Researchers
  • (In Japanese)湊元 幹太
  • (In Japanese)吉川 研一
Affiliation
  • (In Japanese)名古屋大学大学院人間情報学研究科
  • (In Japanese)京都大学大学院理学研究科
Research organization
  • (In Japanese)名古屋大学大学院人間情報学研究科
  • (In Japanese)京都大学大学院理学研究科
Report name (In Japanese)DNA折り畳み転移において塩濃度依存的に形成される分子鎖内相分離構造
Technology summary (In Japanese)近年,DNAの折り畳み転移が,個々の分子鎖の広がった状態と折り畳まれた状態の2状態の間を不連続に転移する高次構造のスイッチングであることが明らかになった。ここでは,これまでより10倍濃いNaCl濃度の溶液中において,ポリアミンの濃度増加に伴う折り畳み転移の様子を蛍光顕微鏡により観測した。この折り畳みが10 mM Tris-HCl緩衝液中では不連続なスイッチング(分子鎖間相分離)として観測されるのに対して,100 mM NaClを含む10 mM Tris-HCL緩衝液中では転移領域において図1のようなDNA単分子鎖の高次構造が高頻度で現われる転移として観測された。これは1本のDNA分子鎖上に広がった状態と折り畳まれた状態とが分離・共存しており,分子鎖内相分離構造と呼ぶことができる。一価塩濃度の増大は,多価カチオンによるDNAの折り畳み転移を,単分子鎖レベルの構造のスイッチングから,分子鎖内ドメインのスイッチングに変えると考えられる。
Drawing

※Click image to enlarge.

R000000641_01SUM.gif
Research field
  • Optical instruments and techniques in general
  • Phase transitions and critical phenomena in general
  • Phase equilibrium, phase diagram of one‐component systems
  • Physical properties of polymer solutions
  • Nucleic acids in general
Published papers related (In Japanese)(1)K. Tsumoto and K. Yoshikawa, Biophys. Chem. 82 (1999) 1-8.
Research project
  • Core Research for Evolutional Science and Technology;Creation and Functions of New Molecules and Molecular Assemblies
Information research report
  • (In Japanese)湊元 幹太,吉川 研一. DNA折り畳み転移において塩濃度依存的に形成される分子鎖内相分離構造. 戦略的基礎研究推進事業 分子複合系の構築と機能 平成12年度 シンポジウム,2000. p.69 - 69.

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