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(In Japanese)ロドプシンの光活性化機構

Research report code R013000410
Posted date Oct 1, 2003
Researchers
  • (In Japanese)石黒正路
  • (In Japanese)Hirano Takahiro
  • (In Japanese)In Taek Lim
  • (In Japanese)Don Moon Kim
  • (In Japanese)yosihara Kazuo
  • (In Japanese)Sitida Yosinori
Affiliation
  • (In Japanese)Suntory Inst. Bioorganic Res.
  • (In Japanese)Suntory Inst. Bioorganic Res.
  • (In Japanese)Suntory inst. Bioorganic Res.
  • (In Japanese)Suntory Inst. Bioorganic Res.
  • (In Japanese)Suntory Inst. Bioorganic Res.
  • (In Japanese)Kyoto Univ.
Research organization
  • (In Japanese)Suntory Inst. Bioorganic Res.
  • (In Japanese)Kyoto Univ.
Report name (In Japanese)ロドプシンの光活性化機構
Technology summary (In Japanese)ロドプシンの結晶構造を用いて分子動力学計算を行い、視物質の発色団であるレチナールの光異性化反応と、その後の熱反応による発色団の構造の緩和過程について調べた。11シス型から全トランス型への光異性化は、C11=C12結合と隣り合うC12-C13結合が同時に回転することで実現した。その結果バソ中間体では、発色団はC11=C12及びC12-C13の部分でねじれた全トランス型の構造を持つようになる。ロドプシン及びバソ中間体の発色団はそれぞれ右手らせん型及び左手らせん型の構造をとったが、それぞれ500nmと540nmに特徴的な円二色性スペクトルを示すことが知られていることから、今回の計算結果は妥当なものと考えられる。また、9-cis-12-s-trans-locked- retinalを用いた光反応の実験と計算結果から、この発色団類縁体を結合したロドプシンは通常とは異なる構造をとることが示唆された。
Drawing

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R013000410_01SUM.gif
Research field
  • Rearrangement reaction, isomerization
  • Photochemical reactions
  • Vitamin A
  • Proteins and peptides in general
Research project
  • Core Research for Evolutional Science and Technology;Creation and Functions of New Molecules and Molecular Assemblies
Information research report
  • (In Japanese)石黒正路,Hirano Takahiro,In Taek Lim,Don Moon Kim,yosihara Kazuo,Sitida Yosinori. A Mechanism of Photo-Activation of Rhodopsin. 戦略的基礎研究推進事業 分子複合系の構築と機能 平成13年度シンポジウム,2001. p.69 - 69.

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