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(In Japanese)蛋白質立体構造データベースの構築と利用システムの開発

Research report code R030000345
Posted date Feb 22, 2005
Researchers
  • (In Japanese)楠木 正巳
Affiliation
  • (In Japanese)大阪大学蛋白質研究所
Research organization
  • (In Japanese)大阪大学
Report name (In Japanese)蛋白質立体構造データベースの構築と利用システムの開発
Technology summary (In Japanese)研究開発題目1「蛋白質立体構造データベース編集システムの構築と運用」プロテインデータバンクを構築・運営する国際的な協力体制の一環として大阪大学蛋白質研究所においてアジア・オセアニア地区のPDBエントリーの登録・編集することを企画し、エントリーの登録・編集体制を整えた。2001年9月末で400個のPDBエントリーの編集を行い、順調に運用している。研究開発題目2「蛋白質立体構造データベースを利用した全自動分子置換解析システムの開発」蛋白質のネイティブ結晶のX線回折データだけを用いる分子置換法に基づき、利用者がインターネット上のWEBサーバに必要なデータを入力することにより構造解析を実行するシステムを開発した。データの入力から構造解析のシステムの表示までのシステムが完成し、いくつかの新規蛋白質結晶の構造を解析した。研究開発題目3「蛋白質基本構造解明プロジェクトへの協力」PDBエントリーに、構造ゲノムプロジェクトに関連した項目を追加することなどで協力を実施している。
Drawing

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R030000345_01SUM.gif R030000345_02SUM.gif
Research field
  • Proteins and peptides in general
  • Database systems
Research project
  • Research and Development for Applying Advanced Computational Science and Technology(ACT-JST) ;Life Science (Basic Type)
Information research report
  • (In Japanese)楠木 正巳. 蛋白質の立体構造データベースの構築と利用システムの開発. 計算科学技術活用型 特定研究開発推進事業 平成10年度採択基本型 研究開発成果報告会 予稿集 ~計算で、見る・知る・予測する~ 2001. p.27 - 30.

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