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(In Japanese)立体構造に基づく酵素触媒反応の解析・表現法

Research report code R070000197
File No. R070000197
Posted date Apr 11, 2008
Researchers
  • (In Japanese)長野 希美
Affiliation
  • (In Japanese)産業技術総合研究所
Research organization
  • (In Japanese)産業技術総合研究所
Report name (In Japanese)立体構造に基づく酵素触媒反応の解析・表現法
Technology summary (In Japanese)従来の酵素の分類である酵素番号は、主に基質・産物の化学構造や、触媒反応に関わる補酵素などに基づいて分類が行われており、触媒機構において重要である蛋白質の配列情報や立体構造に関する情報が全く考慮されていませんでした。そこで、酵素とリガンドの反応部位に特に注目し、酵素立体構造のPDBデータにおけるリガンドとの関係の解析から酵素触媒機構の系統的な分類までを行い、酵素触媒機構データベース・EzCatDB1,2を開発しました。酵素の触媒機構は、蛋白質の立体構造と同様に、階層的に分類することができます。この階層的触媒機構分類は、従来の酵素番号による分類と比べて、酸素活性部位の構造と機能との関係に大きく反映します。
Drawing

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Research field
  • Molecular structure
  • Enzyme in general
Published papers related (In Japanese)(1) Nozomi Nagano, (2005), EzCatDB: The Enzyme Catalytic-Mechanism Database. Nucleic Acids Rearch. 33 (1) Database Issue. in press.
Research project
  • Precursory Research for Embryonic Science and Technology.;Structure and Function of Biomolecules
Information research report
  • (In Japanese)長野 希美. 立体構造に基づく酵素触媒反応の解析・表現法. 2004年度“たんぱく質関連領域”合同シンポジウム 要旨集 「生体分子の形と機能」, 2004. p.59 - 62.

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