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(In Japanese)大腸菌におけるゲノム機能の体系的解析

Research report code R000000243
Posted date Sep 30, 2002
Researchers
  • (In Japanese)森 浩禎
Affiliation
  • (In Japanese)奈良先端科学技術大学院大学・遺伝子教育研究センター
Research organization
  • (In Japanese)奈良先端科学技術大学院大学遺伝子教育研究センター
Report name (In Japanese)大腸菌におけるゲノム機能の体系的解析
Technology summary (In Japanese)研究開発は材料,情報解析,データベース,網羅的機能解析の4つに分けて進めているが,本年度は以下の材料開発に特に集中して行った。
1)全遺伝子のクローン化とDNAマイクロアレーの作成,
2)トランスポゾンを用いた網羅的破壊株の作成,
3)非必須領域の欠失株作成,
4)質量分析計を用いた網羅的蛋白質インデックスの作成。
Research field
  • Structure and chemistry of genes
  • Physiology and pathogenicity of microbial infection
  • Differentiation, propagation, growth, reproduction
Published papers related (In Japanese)(1)Itoh T., Okayama T., Hashimoto H., Takeda J., Davis RW., Mori H. and Gojobori T. A low rate of nucleotide changes in Escherichia coli K-12 estimated from a comparison of the genome sequences between two different substrains, FEBS Letters 450, 1-2, 72-76, 1999
(2)Itoh T., Takemoto K., Mori H. and Gojobori T. Evolutionary instability of operon structures disclosed by sequence comparisons of complete microbial genomes, Mol Biol vol.16, No.3,332-346, 1999
(3)Itoh T., Matsuda H. and Mori H. Phylogenetic analysis of the third hsp70 homolog in Escherichia coli; a novel member of the Hsc66 subfamily and its possible co-chaperone. DNA Research 6, No.5, 299-305, 1999
(4)Abe T., Kanaya S., Kinouchi M., Kudo Y., Mori H. and Matsuda H., C.D. Carpio, T. Ikemura, Gene classification method based on batch-learning SOM, Genome Informatics Series No.10, 314-315, 1999
Research project
  • Core Research for Evolutional Science and Technology;Structure and Function of Genomes
Information research report
  • (In Japanese)森 浩禎. ゲノム構造と機能 大腸菌におけるゲノム機能の体系的解析. 戦略的基礎研究推進事業 平成11年度 研究年報.科学技術振興事業団, 2000. p.753 - 760.

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