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NMR SIGNAL REVERSION SUPPORTING SYSTEM

Seeds code S100002729
Posted date Nov 5, 2010
Researchers
  • (In Japanese)稲垣 冬彦
  • (In Japanese)横地 政志
Name of technology NMR SIGNAL REVERSION SUPPORTING SYSTEM
Technology summary (In Japanese)アミノ酸配列読み込み指示入力手段がアミノ酸配列の、スペクトル読み込み指示入力手段が2次元及び3次元スペクトルの、それぞれ読み込みを指示する。3次元スペクトル表示手段は、2次元スペクトルのピークが指定されることで、対応する複数の3次元スペクトルを表示する。ボンド・コネクティビティ指示入力手段は、2次元スペクトル又は3次元スペクトルを用いてピークが帰属するボンド・コネクティビティを関連づける。原子型指示入力手段は、ボンド・コネクティビティの原子型を指示する。クラスタ表示手段は、ボンド・コネクティビティの一意に連続したものをまとめてクラスタとし、アミノ酸配列の候補と作成されたクラスタとを、両者の関連性の確率を計算し、対応させて表示する。クラスタ帰属指示入力手段は、表示されたアミノ酸配列の候補と、クラスタの両者を関連づけるクラスタ帰属指示を入力する。クラスタ帰属指示入力手段は、クラスタに含まれないピークをフラグメントとして検出し、アミノ酸配列の候補と対応させて表示する。フラグメント帰属指示入力手段は、両者を関連づけるフラグメントの帰属の指示を入力する。
Research field
  • Research methods in genetics
  • Molecular structure
  • NMR in general
Seeds that can be deployed (In Japanese)NMRシグナルの正確な帰属を行うための支援システムを提供する。
主鎖帰属は1-3日へ、構造決定も2ヵ月程度に短縮することができる。初心者でも、熟練者同様に確度の高い帰属と精度の高い構造解析を行うことができる。
Usage Use field (In Japanese)タンパク質立体構造解析、NMRシグナル帰属
Application patent   patent IPC(International Patent Classification)
( 1 ) (In Japanese)国立大学法人 北海道大学, . (In Japanese)稲垣 冬彦, 横地 政志, . NMR SIGNAL REVERSION SUPPORTING SYSTEM. P2003-139832A. May 14, 2003
  • G01R  33/32     
  • G06T  17/40     

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